《本草品汇精要》是明孝宗（1503年）8月下诏太医院编修的一部国家药典。但是，此书完稿后仅两个月，明孝宗却意外“驾崩”，其死因成为天大疑案。而编纂人员中的49人中有12人涉嫌谋害孝宗皇帝，遭到查办，于是这部明代药典《本草品汇精要》一直封藏在宫中内库里。
李时珍是在距此事约50年后左右进入太医院任职的，他不可能对前朝旧事一无所知。但是都过了半个世纪了，朝廷上下谁还会关心这件事呢。所以，小奇怀疑李时珍在太医院工作期间可能悄悄地偷窥了封藏在宫中的国家机密文件《本草品汇精要》，并做了拷贝，因此总担心人身不安全，这也可能是他托病辞职离开北京的原因吧。
从嘉靖三十一年（1552）开始，李时珍用了二十六年，走遍了全国各地，尝遍了无数植物药材，查遍了世上的所有医书，最终完成了这部中国历史上最伟大的医学著作——《本草纲目》。
这本书后来传遍了全世界，是世界上影响最大、最早创造植物分类法，考订详细的药物学著作。据不完全统计，《本草纲目》在世界上有拉丁文、法文、德文、英文、日文、俄文、西班牙文、朝鲜文等八种文字的译本流传。被誉之为‘东方医学巨典’。达尔文在《人类的由来》一书中，还把它称为“中国古代的百科全书”。
也就是这本书，让李时珍的声望在他那个时代超越了皇帝嘉靖、名臣海瑞、张居正，成为被世界公认的伟大科学家。
